Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRCAPQ6ZRS2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms