Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM136Q6ZRR5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms