Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms