Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPPQ6IPU0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms