Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms