Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC3LQ5T215 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC3LQ5T215 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC3LQ5T215 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms