Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms