Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FGD3Q5JSP0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms