Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM41BQ5BJD5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM41BQ5BJD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms