Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms