Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms