Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL40Q2TBA0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms