Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms