Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCK2Q16822 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCK2Q16822 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms