Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NTRK2Q16620 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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