Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SSX2Q16385 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSX2Q16385 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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