Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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