Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNHIT3Q15649 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms