Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SIX1Q15475 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX1Q15475 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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