Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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NCF4Q15080 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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NCF4Q15080 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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NCF4Q15080 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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NCF4Q15080 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCF4Q15080 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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