Protein–RNA interactions for Protein: Q14790

CASP8, Caspase-8, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8Q14790 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP8Q14790 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP8Q14790 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms