Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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