Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA4Q13772 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOA4Q13772 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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