Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB31Q13636 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB31Q13636 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms