Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL3Q13618 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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