Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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