Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBB3Q13509 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms