Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTBP1Q13363 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP1Q13363 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms