Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAF2Q12933 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms