Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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