Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms