Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms