Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms