Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 ISU1YPL135W 498 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SLM6YBR266C 453 nt3.2□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 EPL1YFL024C 2499 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SNF12YNR023W 1701 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 PSF1YDR013W 627 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RPC10YHR143W-A 213 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YKL100CYKL100C 1764 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 KIN82YCR091W 2163 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RSE1YML049C 4086 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SEC15YGL233W 2733 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 CWC22YGR278W 1734 nt3.19□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 STU2YLR045C 2667 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RCY1YJL204C 2523 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 TIF35YDR429C 825 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RPL39YJL189W 156 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SHE2YKL130C 741 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 MSH2YOL090W 2895 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SIN3YOL004W 4611 nt3.18□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 XRN1YGL173C 4587 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 REC8YPR007C 2043 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 TSA2YDR453C 591 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 IRC4YDR540C 540 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 ERG28YER044C 447 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 MSL1YIR009W 336 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YJR023CYJR023C 402 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 snR191snR191 274 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YME2YMR302C 2553 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 NDT80YHR124W 1884 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 BUB1YGR188C 3066 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RRM3YHR031C 2172 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 BCH1YMR237W 2175 nt3.17□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YDL242WYDL242W 354 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 CAJ1YER048C 1176 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 HMF1YER057C 390 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 RPL37AYLR185W 267 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SWD3YBR175W 948 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SNX41YDR425W 1878 nt3.16□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 TFB1YDR311W 1929 nt3.15□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 YSP2YDR326C 4317 nt3.15□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 NDD1YOR372C 1665 nt3.15□□□□□ -1.9
SGO1Q08490 SMC2YFR031C 3513 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 HPA3YEL066W 540 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 PHD1YKL043W 1101 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YKL111CYKL111C 336 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 EGD1YPL037C 474 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YPL238CYPL238C 390 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 BIT61YJL058C 1632 nt3.15□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 RIF1YBR275C 5751 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 TMA10YLR327C 261 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 ISF1YMR081C 1017 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 PGA1YNL158W 597 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YPR014CYPR014C 330 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YOP1YPR028W 543 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 NMA111YNL123W 2994 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 IOC3YFR013W 2364 nt3.14□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 ATP22YDR350C 2055 nt3.13□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 DNM1YLL001W 2274 nt3.13□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 GPI14YJR013W 1212 nt3.13□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 UTP30YKR060W 825 nt3.13□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YSW1YBR148W 1830 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 CCT7YJL111W 1653 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 GIS4YML006C 2325 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 RPL23BYER117W 414 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 PAU14YIL176C 363 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 PAU1YJL223C 363 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 MYO5YMR109W 3660 nt3.12□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 RMT2YDR465C 1239 nt3.11□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.11□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 BAT1YHR208W 1182 nt3.11□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 URM1YIL008W 300 nt3.11□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.11□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 MET10YFR030W 3108 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 CDH1YGL003C 1701 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 TAF2YCR042C 4224 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 DYN2YDR424C 279 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YFR056CYFR056C 369 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 IRC23YOR044W 474 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 DRS2YAL026C 4068 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 ORC1YML065W 2745 nt3.1□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 YBP1YBR216C 2025 nt3.09□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.09□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 FCF2YLR051C 654 nt3.09□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 SPP382YLR424W 2127 nt3.09□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 OSH6YKR003W 1347 nt3.09□□□□□ -1.91
SGO1Q08490 FLO5YHR211W 3228 nt3.09□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 PDC2YDR081C 2778 nt3.09□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RGC1YPR115W 3252 nt3.09□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YFL063WYFL063W 456 nt3.08□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPS22BYLR367W 393 nt3.08□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPA190YOR341W 4995 nt3.08□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 NOT5YPR072W 1683 nt3.08□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 DIA2YOR080W 2199 nt3.07□□□□□ -1.92
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