Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL18Q07020 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms