Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms