Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLOD1Q02809 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms