Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
CLTCQ00610 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLTCQ00610 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms