Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD3P84022 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms