Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms