Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATXN1P54253 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms