Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX1P48742 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX1P48742 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LHX1P48742 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LHX1P48742 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms