Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCC3P46736 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms