Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL3P36405 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL3P36405 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL3P36405 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL3P36405 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms