Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD12P35452 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms