Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms