Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRS3P32247 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRS3P32247 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
BRS3P32247 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRS3P32247 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRS3P32247 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms