Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA3P26006 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms