Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCM3P25205 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCM3P25205 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCM3P25205 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCM3P25205 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCM3P25205 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCM3P25205 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCM3P25205 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms