Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CXCL3P19876 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL3P19876 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms